ssr引物筛选
问题描述：
ssr引物筛选
我是做分子标记的,现在遇到一些问题?1、根据引物报告单上的退火温度,上游和下游温度不一样怎么选择?2、我有600对引物,3个亲本,现在要筛一遍,用96孔的PCR板P的时候,每一对退火温度不一样怎么选择一个合适的温度设定?
答
这个还是要将你的600对引物的退火温度作为参考,将比较接近的归为一组,用TOUCHDOWN的PCR程序来做如果上下游退火温度相差太大，那么这一对的温度该怎么取？那最好就退火温度低的 做TOUCHdown