没有完整的ORF是完整的基因么?如何设计引物
问题描述：
没有完整的ORF是完整的基因么?如何设计引物
拼接得出的cDNA序列没有完整的ORF（没有终止密码子）,像这种情况的序列是完整的基因吗?设计引物怎么设计?是根据全长序列设计引物呢,还是仅仅根据 ORF来设计?
设计引物后就要做RT-PCR，然后胶回收再测序。
答
拼接的cDNA序列结果有可能会出现各种各样的情况,没有完整的ORF的话建议你去blast一下基因组序列（如果你所做的物种的基因组已经测的差不多的话）,如果在基因组中能定位到的话就去用基因预测软件预测基因组上的基因并找到外显子,再拼出全长ORF,
如果没有基因组信息那就只能去做5'RACE和3'RACE了,如果能RACE出来经过测序鉴定和你接拼的序列一样说明这个基因确实是存在的,如果RACE不到可能就是假基因,不过如果你是从EST库中拼出来的应该不会是假基因,假基因不会存在于EST库中.祝研究成功