问什么甘氨酸残基具有破坏α螺旋的作用?

问题描述:

问什么甘氨酸残基具有破坏α螺旋的作用?

 α-螺旋(α-helix):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺氮形成氢键。在古典的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。
Pro(及Hpro)使α-螺旋中断,产生“结节”。Pro的α-碳原子参与吡呤环的形成,使α-碳原子—N键不能旋转,Gly绕α-碳原子的*度更大,所以大多α-螺旋起始或中止于Gly。

甘氨酸残基出现的部位,不种于α-螺旋的形成
甘氨酸R基为H,所占空间很小,会影响该处螺旋的稳定
甘氨酸R基为H,在形成三级结构时不能与其它侧链基
团形成次级键,所以不利于α-螺旋的稳定