如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物

问题描述:

如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物

可以找公司合成

在指定的DNA序列上找一小段(一般18-30碱基)序列,一般要求GC含量在40-60%之间,没有错配和发夹结构(delta G绝对值越小越好),如果成对设计,要求正负引物Tm值相近

把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度) 延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因,引物必须要在起始密码子之前,或包含起始密码子.最后加上酶切位点就可以了.