DNAman 怎么分析序列的酶切位点
DNAman 怎么分析序列的酶切位点
将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框.
参数说明如下:
Results 分析结果显示
其中包括:
Show summary(显示概要) Show sites on sequence(在结果中显示酶切位点)
Draw restriction map(显示限制性酶切图)Draw restriction pattern(显示限制性酶切模式图)
Ignore enzymes with more than(忽略大于某设定值的酶切位点)
Ignore enzymes with less than(忽略小于某设定值的酶切位点)
Target DNA (目标DNA 特性)
circular(环型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)
参数说明如下:
Enzyme
代表(enzyme data file),点击旁边的下拉按钮,出现两个默认选项,restrict.enz 和dnamane.enz,
如果添加过自制的酶列表,则附加显示自制酶列表文件名.其中restrict.enz 数据文件包含180 种
限制酶,dnamane.enz 数据文件包含2524 种限制酶.选择其中一个数据文件,相应的酶在左边的 显示框中列出(按酶名称字母表顺序),鼠标双击酶名称,则对应的酶被选中,在右边空白框中列 出.要自制酶切列表,可以从左边酶列表中双击鼠标选择多种酶(例如puc18 multiple cloning sites),然后点击按钮出现下列对话框:输入要保存酶列表的文件名,点击按钮即可保存.自制酶列表可以方便分析特定的酶切位点.
Cutter 酶切识别序列长度;End 酶切产生的末端,其中包括,Blunt(平头末端),5’Overhang
(5’突出粘性末端),3’Overhang(3’突出粘性末端),系统根据cutter 和end 的设定情况,在左边酶列表 中显示符合条件的酶.最后,点击按钮执行操作.