Linux上的这些orf分别什么意思啊,
Linux上的这些orf分别什么意思啊,
>comp1_c0_seq1_1_ORF1 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 1,threshold 1,41aa
ILNESHLYFQLSSLTTFVLCKGMLQHSNANPSLNWLFNGLG
>comp1_c0_seq1_1_ORF2 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 2,threshold 1,9aa
ITHPLDLRI
>comp1_c0_seq1_1_ORF3 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 3,threshold 1,66aa
NTVGRTPCHPYERICSCKQGILAAAREVHSSGHPGRCPHTLPPGSQVVSPCQFSSGWLHC
WSLFEI
>comp1_c0_seq1_1_ORF4 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 4,threshold 1,21aa
TSLVFLSDSHPPRTQPESLTF
提问分类错误 这跟linux没有关系
orf是读框 这里命名不规则 不知道
41aa 是41个氨基酸您好，不是有六个读框么，用cat ,,,,,fasta 之后，出现比如>comp1_c0_seq1_1_ORF1 ，，，，>comp1_c0_seq1_6_ORF3，，，，一直到>comp1_c0_seq1_6_ORF12 ，从ORF1到12是什么。seq1-1到seq1-6，这应该是表示六个读框吗？在seq1—6中，又有seq1_6_ORF1到seq1_6_ORF12。从ORF1到12又是什么seq是不同序列 ORF是不同读框 。。。这样命名只有看说明档才知道他具体在写什么东西。。