水稻纯度鉴定 DNA分析方法 使用哪个SSR引物,只用一对还是几对还是全部?

一般纯度鉴定都是针对一个基因或一个区域的,这时,针对目标位置设置一对SSR引物即可.对于没有设定特定位点的检测,因为在一个位置可能是一个纯度,但不代表另一个位置也是这个纯度,此时,当然是多用SSR引物对了.GB/T20396-2006说的选用12对引物，这12对引物同时加入一个PCR管，还是只能一对加入一个PCR管，如果是12对那么一粒种子就要做12个PCR管？应该是一个PCR管加一对引物！其实对于检测来说，做12个PCR也不算麻烦，毕竟只是个PCR时间--仅几个小时的事情。 我所见过的混合PCR，也仅是多至3对引物而已! 如果引物太多，一是整个PCR微环境变得复杂，可能达不到单个引物扩增时的效果，二是那么多的条带，看得人眼花缭乱也不好判断。这样算来，对于杂交水稻至少取200粒种子，每粒种子提取DNA后都要分别用12个PCR管，每个PCR管加一对引物，一共2400个PCR管，2400对引物，每个PCR管还要标明是哪一粒种子，如果有两个位点不同就是杂株。如果是200粒种子，确实要2400个PCR管，但不是2400对引物，还是12对引物： 第一对引物：扩200个 第二对引物：扩200个……第十二对引物：200个