在转录组测序分析中,对于没有参考基因组信息的序列怎样进行注释,差异分析 此外,在转录组结果分析中,转录本有没有通俗一点的解释,或者,转录本有没有一个固定的含义还是说不同情况下含义不同?
问题描述：
在转录组测序分析中,对于没有参考基因组信息的序列怎样进行注释,差异分析
此外,在转录组结果分析中,转录本有没有通俗一点的解释,或者,转录本有没有一个固定的含义还是说不同情况下含义不同?
答
没有参考基因的话就拼接啊！组装后得到unigene在NR，SWISSPROT COG gO kegg等库注释。差异基因分析参照rpkm
答
转录本是一个基因序列通过一种剪切后所得的能RNA.以前说转录本都是说表达蛋白的.现在LncRNA的研究多了,也说是一个转录本了.还有没有参考基因组序列的,一般是不可能去GO功能注释的.因为去功能注释的时候要有一个背景.