我看了你对“转录组测序与转录表达谱测序的异同”的回答我非常感兴趣,我现在想做非模式植物的基因表达谱芯片,但是因为没有已知序列,考虑到用EST设计探针做杂交的效果估计不会太好,但用转录组测序后做又有些不太具体了解,不知能否介绍一下转录组测序完成后如何来设计表达谱芯片的探针.
问题描述：
我看了你对“转录组测序与转录表达谱测序的异同”的回答我非常感兴趣,
我现在想做非模式植物的基因表达谱芯片,但是因为没有已知序列,考虑到用EST设计探针做杂交的效果估计不会太好,但用转录组测序后做又有些不太具体了解,不知能否介绍一下转录组测序完成后如何来设计表达谱芯片的探针.
答
转录组测序后再用RNA-seq做表达谱分析,完全基于测序也可以进行表达谱分析.