深度测序的read是什么 mapping到基因组是RNA还是DNA基因组.是否所有的深度测序都要RNA先反转录成cDNA

问题描述:

深度测序的read是什么 mapping到基因组是RNA还是DNA基因组.是否所有的深度测序都要RNA先反转录成cDNA

只的是高通量测序吧,相当于有多少条DNA被读了,被测了得意思。只有把RNA构建成cDNA文库才能测序。

read就是一个个的转录本,mapping到基因组,是到DNA基因组。这样就可以判断哪些基因被转录了?转录的水平如何? 你做的材料首先要已经被测序才能被mapping到DNA基因组。对于还没有被测序的物种,可以首先拿已经测序的近亲物种作为参考基因组,也可以得到转录本的详细GO信息。希望对你有所帮助!

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将DNA打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads.至于是mapping到基因组还是DNA基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的...