要配置多少的酶切体系,载体和插入DNA的量要加多少?
要配置多少的酶切体系,载体和插入DNA的量要加多少?
因为内切酶的酶活性单位定义是在50ul反应体系中,最适温度反应1小时能够讲1ugDNA完全酶切的酶量.所以,一般在酶切体系里,DNA的量是可以加到非常大的.因为考虑到后期的纯化后DNA的损失问题,所以推荐酶切体系中的DNA尽量多加一些.这样你纯化回收后的DNA剩下的就比较多,有利于后期的连接以及筛选.具体的话,我经常做的就是50ul体系中除了buffer和酶以外,其他的成份全部都是载体或者插入片段的溶液.当然,你得保证你的DNA浓度约可以达到50ng/ul左右的浓度.最后,做连接的时候一定要注意插入片段和载体的摩尔比,理想状态下应该是3-10比1.要是知道了载体和插入片段的浓度怎么计算摩尔比?希望详细点,最好可以举个例子。还有就是怎么根据跑的电泳的结果来判断载体和插入DNA的浓度?非常感谢,因为第一次做,什么都不懂,教授逼得还比较紧,麻烦您了!!简单来说,分子量越大,同样质量浓度的DNA摩尔浓度越小,因为都是DNA分子,所以这只是一个非常简单的比例换算问题了。举个例子来说,假设载体与插入片段浓度一致,载体是10kb,插入片段是1kb,要达到载体比插入片段的摩尔比为10比1的时候,那么你加入的载体和插入片段体积就应该是1比1。另外关于DNA浓度,你可以看下你的marker说明上是否有标明条带的DNA浓度,如果有,那么根据电泳的条带亮度与marker亮度对比去估计DNA浓度,如果没有的话,用分光光度计去测A260nm的OD值。如果测量OD值的话,你只要得到插入片段和载体的OD值比例关系就行了,因为具体计算的时候考虑的也只是比例而不是实际浓度。当然,你至少得保证,你的载体片段和插入片段进行电泳的时候,能够看到清晰的条带。