为什么基因测序前将基因PCR克隆后还要放到大肠杆菌载体上再测序?除了防止PCR产物降解外还有别的原因吗?
问题描述:
为什么基因测序前将基因PCR克隆后还要放到大肠杆菌载体上再测序?
除了防止PCR产物降解外还有别的原因吗?
答
你说的应该是将PCR产物放到质粒上,这样做好处很多,第一,质粒的测序要更容易,而扩增的产物测序相对容易失败,第二,质粒的序列是已知的,你只需要给测序公司提供质粒的类型,他们就可以用自备的通用引物进行测序,而不需要你额外提供引物,而且你可以很多样品都用一个通用引物来测序,只要他们都是放到同一类型的质粒载体上就行,节约不少精力、经费哦。
答
补充一个更重要和实际的考虑:实际测序中,可靠的测序结果往往是从引物后二三十个碱基才开始的。如果片段比较长,超过一次测序能力如七八百之外,即使双向测序也无法获得引物(排除非特异扩增)或紧邻引物处的序列时,就需要克隆到载体再测序。
另外,如果要做后续表达,也必须考虑到引物合成中不可避免的偶发错误,克隆到载体再测序可以清楚的检测。再者,还有比如引入酶切位点,正反向连接等特定实验要求的考虑。
其实我一般都是PCR后直接测序的,因为我多数的实验不做后续表达实验且序列已知。
答
一楼完全没说到重点,二楼正解.你看过测序的结果就知道了,前面的几十个碱基是无法识别的杂峰,最后几百个碱基也是无法识别的杂峰,尽管结果中还是以单个碱基字母的形式给你写出来,但是那是0智商的机器自动记录的,你要人...