Where are you going to spend your holidays this year,Gary?这句话是问Gary将来的打算.为什么要用现在进行时be+V-ing(are-going)呢?

be going to 相当于 will 是将来时的标志
这句相当于 Where will you spend your holidays this year,Gary?

一般将来时，will也用将来时。

be going to +动词原形,表示将要做某事,是一般将来时,
但表示方向或位移的动词,如:come ,go ,leave 可以用进行时态表示将来的事.你那个句子,形式上的确是现在进行时,但表示的就是将来的事哟.再如:I'm leaving right now.就是现在进行时表示将来的事。意思是：我马上要出发了。不是：我正在出发。
好了，希望能帮到你。

现在进行时除表进行外，还可以表示将来。现在进行时表将来时常用“意图”“安排”或“打算”的含义。这种现在进行时比较生动，给人一种期待感。
　　它常表最近或较近的将来，所用动词多是转移动词。如：
　　(1) I’m going. 我要走了。
　　(2) I'm coming.我要来了。
　　(3) When are you starting? 你什么时候动身？
　　表将来的现在进行时除用于转移动词外，亦可用于某些非转移动词。如：
　　(1) I’m meeting you after class. 课后我找你。
　　(2) What are you doing next Sunday? 下星期你打算干什么？
　　(3) She is buying a new bike soon. 她不久将买一辆新自行车。

be going to do不是现在进行时,而是一般将来时的一种表示方法,固定用法