请问设计动物的上游引物时,必须从ATG开始还是可以从ATG的上游开始?
问题描述：
请问设计动物的上游引物时,必须从ATG开始还是可以从ATG的上游开始?
我的学植物的老师说应该从ATG开始,可是我的学动物的同学说可以从ATG的上游开始,因为他只是个载体的作用.我没学过生物.请问应该采取哪种方法?为什么?
答
没有关系的,不影响,只要PCR能p出ATG不影响基因表达就OK,多几个上游碱基没事.关键不在这里在于设计的引物要符合引物设计的基本原则,越符合越好.你好，以DNA作模板，和以mRNA为模板，是否情况不同呢？我跟植物学的老师讨论，他说由于cDNA较短，必须以ATG为模板。是这样吗？多短啊，只要大于100bp应该没啥问题吧。cDNA也是mRNA反转录过来的，mRNA不能直接做模板。上游引物和下游引物加起来肯定要小于CDNA。不明白你要做什么实验？如果是克隆基因然后表达，与ATG没啥关系。只要以后PCR出来的序列有ATG就行啊。如果仅仅鉴别是否有某种基因表达，从那设计都无所谓。如果做real time PCR更与ATG没关系了