-It seems to have too much trouble with my new work,sir -I don't think so.yoyou ____very wellA will do B are doing 答案A为什么不是B

若表示没有经过事先计划或考虑，而是在说话的当时临时想到的意图或临时作出的决定时，则要用will。若表示经过事先考虑好的意图时，要用be going to。例如：
I’ll answer the telephone.我去接电话。（事先没经过考虑）
I’m going to meet him at the railway station. 我去火车站接他。（已经过考虑）

按照前面一句话的意思，你目前正面临工作中的困难，显然你并没有工作的很顺利，这边用will do是说明你将来会处理的很好。如果是are doing的话，表示你目前做的很好，这个与你在工作中表现出一团糟的情况相左，不合逻辑。

你将会做得很好
这个主要是鼓励对方以后会做得很好.用现在时不如将来时恰当

选A 是你会做的很好，B 是你正做的很好，A 肯定更说的通的。