细菌16S rDNA 序列比对,
问题描述：
细菌16S rDNA 序列比对,
菌种鉴定中,已测出待定菌种的16SrDNA序列.那么：
1、在NCBI上比对时,有三个属的多个已知菌种与新菌匹配率都95%以上,值最高的那个属其实真的在预料之外,而且文献中也没看到.那么可不可以把新菌鉴定为另一个属呢（也就是max ident相对低一点点,但文献中报道较多的那个?）
2、比对后的匹配率至少要达到多少才有说服力呢（确定为该属）?
3、在比对时,有的尽管匹配率（max ident）高,但匹配值（max score）小,或覆盖率（Query coverage）小.那么按照怎样的轻重顺序综合考虑这些关系呢?
答
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