solexa测序时的测序深度和覆盖度是怎么理解,怎么区别的
问题描述:
solexa测序时的测序深度和覆盖度是怎么理解,怎么区别的
答
测序深度(Sequencing Depth):测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,它是评价测序量的指标之一.测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降.重测序的个体,如果采用的是双末端或Mate-Pair方案,当测序深度在10~15X以上时,基因组覆盖度和测序错误率控制均得以保证.