You must know why i am calling you.此句中有情态动词must,怎么又能用动词的ing形式呢

是这样的,这个句子中,must接的动词是know而不是calling.
这个句子的结构是这样的：
You是主语；
must know是谓语,是情态动词加动词原形的结构；
why I am calling you是宾语,这是一个宾语从句.
在这个宾语从句中：
I是主语；
am calling是现在进行时的谓语；
you是宾语.
因此,这个calling跟must没有关系,也就不影响must后面接原形了.
如果还有问题,欢迎追问.