在DGGE实验中,胶回收后要测序前的PCR扩增时引物必须为不带GC夹子的吗?我用带GC夹子在DGGE实验中,胶回收后要测序前的PCR扩增时引物必须为不带GC夹子的吗?我用带GC夹子的扩增了,有三个条带已送测序公司测序,得到了序列。结果能用吗?

问题描述:

在DGGE实验中,胶回收后要测序前的PCR扩增时引物必须为不带GC夹子的吗?我用带GC夹子
在DGGE实验中,胶回收后要测序前的PCR扩增时引物必须为不带GC夹子的吗?我用带GC夹子的扩增了,有三个条带已送测序公司测序,得到了序列。结果能用吗?

得到的序列中,把GC夹子的序列去掉就可以了。

可视测序结果的质量决定。如果测序结果的ab1文件中的峰图清晰锐利,且主峰与背景区别明显则可使用。

一般不用带GC的,这主要是因为高GC序列的测序结果会受到比较大得影响,如果测出来的峰都不错,可以去除前面一段GC夹子后还是一样用的