能否算的PCR后的未知DNA 在电泳后算出DNA bp一段未知dna通过随机引物PCR后,再经电泳得出条带,能否算出其未知DNA的Bp,公式是什么?
问题描述:
能否算的PCR后的未知DNA 在电泳后算出DNA bp
一段未知dna通过随机引物PCR后,再经电泳得出条带,能否算出其未知DNA的Bp,公式是什么?
答
能的吗?不能吧。
不能直接用纯DNA拿去测序吗?
或者直接跑个电泳跟Marker对比一下。
答
不能吧,因为是随机引物,所以你不知道这对引物在DNA 上的结合位置,因此不能通过扩增产物的大小推测模板的大小吧
欲知模板大小,可以通过脉冲场电泳或者其他手段吧
答
When you run an agarose gel with PCR product,you can calculate the PCR size by comparing to the DNA standards.
答
算出未知DNA的Bp?一般不能。
分子生物学上,通常借用已知的DNA(bp)标准,跟你的未知DNA一起电泳,作为对照。 然后估计你的未知DNA的bp。注意,这里是“估计” 不是准确计算的。
bp估计的依据和分子量估计依据是一样的:lgMr=lgK-bm=K1-bm
式中,Mr代表蛋白质分子量,K、K1是常数,b代表斜率,m代表迁移率。
当然了 电泳中DNA的位置跟很多因素有关,尤其是跟其是否呈现螺旋状态有关。 跟分子量相关的那个“计算”,是假定它跟Marker的结构相同,一般用于线形分子更准确。