基因突变是生物变异的根本来源，是生物进化的原始材料，原因不包括（　　）A. 能产生多种多样的基因型组合方式B. 基因突变是不定向的，可以产生适应环境的新性状C. 能产生新的基因D. 突变率低，但是普遍存在的

A、基因突变不能产生多种多样的基因型组合方式，只有基因重组才能产生多种多样的基因型组合方式，A错误；
B、基因突变产生的变异是不定向的，可以产生适应环境的新性状，B正确；
C、基因突变是生物变异的根本来源，是生物进化的原始材料，因为基因突变能产生新的基因和基因型，C正确；D、基因突变存在低频性，但在生物界普遍存在，D正确．
故选：A．
答案解析：基因突变的结果是形成等位基因，进而产生新的基因型．基因突变是随机发生的，具有不定向的；多数是有害的，但不是绝对的，有利还是有害取决于生物变异的性状是否适应环境．基因突变的频率是很低的，在自然界是普遍存在的．
考试点：基因突变的特征．
知识点：本题考查基因突变的相关知识，意在考查学生的识记和理解能力，难度不大．