有搞生物信息学研究的朋友吗?我想问一下,NCBI里面的序列是不是有很多是计算机预测出来的,而没有经过实验验证,比如那些前面标注着预测和临时的序列,计算机室根据什么原理跑出来的?没有经过试验验证的可信不可信?能不能拿来合成后做表达等下游工作
问题描述:
有搞生物信息学研究的朋友吗?我想问一下,NCBI里面的序列是不是有很多是计算机预测出来的,而没有经过实验验证,比如那些前面标注着预测和临时的序列,计算机室根据什么原理跑出来的?没有经过试验验证的可信不可信?能不能拿来合成后做表达等下游工作
答
NCBI里边的序列是先通过测序,得到一系列的测序数据,用相应的一些数学算法和模型(这个很复杂,不是一两句话就能说清楚的)进行组装,拼接和注释.可以理解为是预测吧,但是这种“预测”是比较准确的,有些实验室测了一些序列,发现一些感兴趣的基因,肯定会拿去做实验验证的,但是还是有很多基因的功能是未知的.